Design 3D de Proteínas via Predição de Estrutura de Proteínas

Aprenda Design de Proteína

- Predição de Estrutura de Proteínas por Homologia

- Modelagem Comparativa com Scripts Python para MODELLER

- Bioinformática Aplicada às Proteínas

- Passo a passo: Utilização de NCBI, BLAST, PDB, CLUSTAL, MODELLER, PYTHON, PYMOL, PDB, ALI, FASTA e Alinhamento

- Conclusão: Obtenção do design tridimensional da proteína ou complementação de resíduos ausentes no PDB.

**Mais Informações:** Se a sua proteína não está em um banco de dados, é necessário modelá-la. Neste curso, você aprenderá a modelar proteínas por homologia, utilizando a modelagem comparativa via MODELLER/PYTHON.

**Recursos Adicionais:**

- Vídeos, aulas e minicursos detalhados sobre modelagem comparativa com PYTHON e algoritmos de bioinformática.

- Exploração dos métodos PSP para modelagem.

- Introdução à predição da estrutura e modelagem comparativa.

- Orientações sobre como buscar e escolher o melhor template para modelagem comparativa por PSP, incluindo alinhamento com Clustal e modelagem com Modeller/Python.

**Bônus:**

- Bioinformática: Conceitos, algoritmos e recursos computacionais como BLAST, NCBI, MUTABIND2, MODELLER, Python, BeAtMuSiC, mCSM-PPI2, JALVIEW, CHIMERA, PYMOL, CSU e GENBANK.

- Quiz Avaliativo.

- Instruções para baixar, instalar e atualizar programas e pacotes para o curso, preferencialmente em ambiente Linux: Gedit, emacs ou outro editor de preferência, MODELLER, Python, Chimera, Pymol.

- Leitura teórica sobre a Bioinformática e a necessidade de modelagem.

- Texto dissertativo preferencialmente via Latex ou okular.

- Leitura teórica sobre a estrutura 3D de proteínas e o enovelamento de proteínas.

- Vídeos sobre proteínas, aminoácidos, doenças amilóides, termodinâmica das proteínas, análise de dados de cristalografia, entre outros.

- Livros, artigos científicos revisados por pares, links, etc.

- Certificado de 40 horas.